Не менш важливою особливістю еукаріотів, є те, що їм властива компартменталізація, забезпечена наявністю внутрішніх мембранних систем. В результаті цього багато ферментів локалізуються в певних компартментах. Наприклад, майже всі ферменти, що каталізують синтез білків в тваринних клітинах, локалізовані в рибосомах, тоді як ферменти, що каталізують синтез фосфоліпідів, в основному зосереджені на клітинній ци-топлазматіческой мембрані. На відміну від прокаріотів клітин в клітині є ядерце.

Еукаріотичні клітини в порівнянні з прокаріотів володіють більш складною системою сприйняття речовин з навколишнього середовища, без чого неможлива їх життя. Існують і інші відмінності між еукаріотичних і прокаріотів клітинами.

Форма клітин буває найрізноманітнішої і часто залежить також від виконуваних ними функцій. Наприклад, багато найпростіші мають овальну форму, тоді як еритроцити є овальними дисками, а м'язові клітини ссавців витягнуті. Розміри еукаріотів є мікроскопічними (табл. 3).

Деякі види клітин характеризуються значними розмірами. Наприклад, розміри нервових клітин у великих тварин досягають декількох метрів у довжину, а у людини - до 1 метра. Клітини окремих тканин рослин досягають декількох міліметрів в довжину.

Вважають, що чим більше організм у межах виду, тим більший його клітки. Однак для споріднених видів тварин, що розрізняються за розмірами, характерні і схожі за розмірами клітини. Наприклад, у всіх ссавців подібні за розмірами еритроцити.

Клітини різняться також і за масою. Наприклад, одиночна клітина печінки (гепатоцит) людини важить 19-9 р.

Соматична клітина людини (типова клітині) являє собою утворення, що складається з безлічі структурних компонентів мікроскопічних і субмікроскопіческіх размеровІспользованіе електронної мікроскопії та інших методів дозволило встановити надзвичайна різноманітність у структурі як оболонки і цитоплазми, так і ядра.